Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB13Q92826 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HOXB13Q92826 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms