Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERVK_113Q902F9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERVK_113Q902F9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HERVK_113Q902F9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms