Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ04

LRTOMT, Transmembrane O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTOMTQ8WZ04 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRTOMTQ8WZ04 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LRTOMTQ8WZ04 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRTOMTQ8WZ04 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRTOMTQ8WZ04 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRTOMTQ8WZ04 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRTOMTQ8WZ04 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRTOMTQ8WZ04 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRTOMTQ8WZ04 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRTOMTQ8WZ04 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRTOMTQ8WZ04 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRTOMTQ8WZ04 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRTOMTQ8WZ04 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRTOMTQ8WZ04 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRTOMTQ8WZ04 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRTOMTQ8WZ04 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRTOMTQ8WZ04 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRTOMTQ8WZ04 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRTOMTQ8WZ04 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRTOMTQ8WZ04 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRTOMTQ8WZ04 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRTOMTQ8WZ04 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRTOMTQ8WZ04 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRTOMTQ8WZ04 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRTOMTQ8WZ04 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRTOMTQ8WZ04 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRTOMTQ8WZ04 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRTOMTQ8WZ04 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LRTOMTQ8WZ04 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
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