Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS9Q8WXC6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS9Q8WXC6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms