Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVS4

WDR60, WD repeat-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR60Q8WVS4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms