Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF5

KCTD4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4Q8WVF5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KCTD4Q8WVF5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
KCTD4Q8WVF5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KCTD4Q8WVF5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCTD4Q8WVF5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCTD4Q8WVF5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCTD4Q8WVF5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCTD4Q8WVF5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD4Q8WVF5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD4Q8WVF5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD4Q8WVF5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD4Q8WVF5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD4Q8WVF5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD4Q8WVF5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD4Q8WVF5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD4Q8WVF5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD4Q8WVF5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD4Q8WVF5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD4Q8WVF5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD4Q8WVF5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD4Q8WVF5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD4Q8WVF5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD4Q8WVF5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD4Q8WVF5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms