Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY9

DEPDC1B, DEP domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1BQ8WUY9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DEPDC1BQ8WUY9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEPDC1BQ8WUY9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DEPDC1BQ8WUY9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEPDC1BQ8WUY9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DEPDC1BQ8WUY9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEPDC1BQ8WUY9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DEPDC1BQ8WUY9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DEPDC1BQ8WUY9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DEPDC1BQ8WUY9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DEPDC1BQ8WUY9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DEPDC1BQ8WUY9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DEPDC1BQ8WUY9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DEPDC1BQ8WUY9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms