Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB4

MGARP, Protein MGARP, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGARPQ8TDB4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MGARPQ8TDB4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms