Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF398Q8TD17 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF398Q8TD17 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.9 ms