Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC12

RDH11, Retinol dehydrogenase 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH11Q8TC12 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH11Q8TC12 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH11Q8TC12 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH11Q8TC12 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH11Q8TC12 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH11Q8TC12 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH11Q8TC12 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH11Q8TC12 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH11Q8TC12 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH11Q8TC12 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH11Q8TC12 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDH11Q8TC12 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDH11Q8TC12 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDH11Q8TC12 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDH11Q8TC12 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDH11Q8TC12 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDH11Q8TC12 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDH11Q8TC12 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH11Q8TC12 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH11Q8TC12 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms