Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMO3Q8TAP4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMO3Q8TAP4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMO3Q8TAP4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMO3Q8TAP4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMO3Q8TAP4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMO3Q8TAP4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMO3Q8TAP4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMO3Q8TAP4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO3Q8TAP4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO3Q8TAP4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO3Q8TAP4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO3Q8TAP4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO3Q8TAP4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO3Q8TAP4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO3Q8TAP4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO3Q8TAP4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO3Q8TAP4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMO3Q8TAP4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms