Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM58Q8NG06 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms