Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIK3C3Q8NEB9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3C3Q8NEB9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms