Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDF8

PAPD5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD5Q8NDF8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAPD5Q8NDF8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAPD5Q8NDF8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAPD5Q8NDF8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD5Q8NDF8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD5Q8NDF8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD5Q8NDF8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD5Q8NDF8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD5Q8NDF8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD5Q8NDF8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD5Q8NDF8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD5Q8NDF8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD5Q8NDF8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD5Q8NDF8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPD5Q8NDF8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPD5Q8NDF8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPD5Q8NDF8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPD5Q8NDF8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPD5Q8NDF8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPD5Q8NDF8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPD5Q8NDF8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPD5Q8NDF8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPD5Q8NDF8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPD5Q8NDF8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAPD5Q8NDF8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAPD5Q8NDF8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAPD5Q8NDF8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAPD5Q8NDF8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAPD5Q8NDF8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAPD5Q8NDF8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAPD5Q8NDF8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAPD5Q8NDF8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PAPD5Q8NDF8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAPD5Q8NDF8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAPD5Q8NDF8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAPD5Q8NDF8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAPD5Q8NDF8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAPD5Q8NDF8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAPD5Q8NDF8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAPD5Q8NDF8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAPD5Q8NDF8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PAPD5Q8NDF8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.1 ms