Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC197Q8NCU1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms