Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HJURPQ8NCD3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms