Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AVL9Q8NBF6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AVL9Q8NBF6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms