Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7R7

CCNYL1, Cyclin-Y-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL1Q8N7R7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNYL1Q8N7R7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNYL1Q8N7R7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms