Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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TMCO5AQ8N6Q1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO5AQ8N6Q1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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TMCO5AQ8N6Q1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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TMCO5AQ8N6Q1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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TMCO5AQ8N6Q1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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TMCO5AQ8N6Q1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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TMCO5AQ8N6Q1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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TMCO5AQ8N6Q1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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TMCO5AQ8N6Q1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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TMCO5AQ8N6Q1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMCO5AQ8N6Q1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO5AQ8N6Q1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO5AQ8N6Q1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO5AQ8N6Q1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO5AQ8N6Q1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO5AQ8N6Q1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO5AQ8N6Q1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO5AQ8N6Q1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO5AQ8N6Q1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO5AQ8N6Q1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO5AQ8N6Q1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO5AQ8N6Q1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO5AQ8N6Q1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO5AQ8N6Q1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO5AQ8N6Q1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO5AQ8N6Q1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO5AQ8N6Q1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO5AQ8N6Q1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO5AQ8N6Q1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO5AQ8N6Q1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO5AQ8N6Q1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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