Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RYBPQ8N488 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RYBPQ8N488 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms