Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCML4Q8N228 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCML4Q8N228 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms