Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GJD3Q8N144 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJD3Q8N144 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms