Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY84

NIM1K, Serine/threonine-protein kinase NIM1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIM1KQ8IY84 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NIM1KQ8IY84 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NIM1KQ8IY84 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms