Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXL6

FAM20C, Extracellular serine/threonine protein kinase FAM20C, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20CQ8IXL6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM20CQ8IXL6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM20CQ8IXL6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM20CQ8IXL6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM20CQ8IXL6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms