Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL3Q8IVW4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL3Q8IVW4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL3Q8IVW4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms