Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB11FIP4Q86YS3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms