Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC84Q86UT8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC84Q86UT8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC84Q86UT8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC84Q86UT8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms