Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATG9AQ7Z3C6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATG9AQ7Z3C6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATG9AQ7Z3C6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATG9AQ7Z3C6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ATG9AQ7Z3C6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATG9AQ7Z3C6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATG9AQ7Z3C6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATG9AQ7Z3C6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATG9AQ7Z3C6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATG9AQ7Z3C6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATG9AQ7Z3C6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms