Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSX7Q7RTT5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms