Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
PTF1AQ7RTS3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTF1AQ7RTS3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms