Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZD4Q76G19 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms