Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms