Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSJ9

SHISA6, Protein shisa-6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA6Q6ZSJ9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHISA6Q6ZSJ9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHISA6Q6ZSJ9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SHISA6Q6ZSJ9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHISA6Q6ZSJ9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHISA6Q6ZSJ9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHISA6Q6ZSJ9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHISA6Q6ZSJ9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHISA6Q6ZSJ9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHISA6Q6ZSJ9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHISA6Q6ZSJ9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHISA6Q6ZSJ9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHISA6Q6ZSJ9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHISA6Q6ZSJ9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHISA6Q6ZSJ9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHISA6Q6ZSJ9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHISA6Q6ZSJ9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHISA6Q6ZSJ9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms