Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms