Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC73Q6ZRK6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC73Q6ZRK6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms