Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NSMFQ6X4W1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms