Protein–RNA interactions for Protein: Q6WBX8

RAD9B, Cell cycle checkpoint control protein RAD9B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9BQ6WBX8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD9BQ6WBX8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RAD9BQ6WBX8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD9BQ6WBX8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD9BQ6WBX8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD9BQ6WBX8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD9BQ6WBX8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD9BQ6WBX8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD9BQ6WBX8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD9BQ6WBX8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD9BQ6WBX8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD9BQ6WBX8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD9BQ6WBX8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms