Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP26C1Q6V0L0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms