Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LMBR1LQ6UX01 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LMBR1LQ6UX01 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMBR1LQ6UX01 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMBR1LQ6UX01 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMBR1LQ6UX01 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMBR1LQ6UX01 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMBR1LQ6UX01 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMBR1LQ6UX01 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMBR1LQ6UX01 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMBR1LQ6UX01 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LMBR1LQ6UX01 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LMBR1LQ6UX01 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMBR1LQ6UX01 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms