Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF7

NXPE4, NXPE family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE4Q6UWF7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXPE4Q6UWF7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXPE4Q6UWF7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXPE4Q6UWF7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms