Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC4A10Q6U841 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC4A10Q6U841 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms