Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SAMD1Q6SPF0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SAMD1Q6SPF0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SAMD1Q6SPF0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms