Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC174Q6PII3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms