Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPRIN2Q6IMN6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms