Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LHX8Q68G74 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LHX8Q68G74 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LHX8Q68G74 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms