Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC102BQ68D86 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC102BQ68D86 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms