Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF8Q5VWM4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms