Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRCH2Q5VUJ6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms