Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF17Q5VTA0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms