Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RIF1Q5UIP0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIF1Q5UIP0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms